Методологія використання програмного забезпечення для аналізу цифрових мікрофотографій на базі курсу патоморфології з метою підвищення професійного рівня студентів і науковців
DOI:
https://doi.org/10.26641/1997-9665.2015.3.122-126Ключові слова:
аналіз цифрових зображень, ImageJ, індекс проліфераціїАнотація
Стаття присвячена методології використання програмного забезпечення для аналізу цифрових мікрофотографій в патоморфології на прикладі розрахунку індексу проліферації зразків з імуногістохімічним забарвленням різними плагінами програми "ImageJ". За мету ставиться ознайомлення студентів медичних факультетів, аспірантів та здобувачів-дослідників з сучасними комп’ютерними технологіями для підвищення їх професійного рівня.
Посилання
Tuominen VJ, Ruotoistenmäki S, Viitanen A, Jumppanen M, Isola J. [ImmunoRatio: a publicly available web application for quantitative image analysis of estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and Ki-67]. Breast Cancer Research. 2010; 12 (4, R56): 1-12.
Konsti J, Lundin M, Joensuu H, Lehtimaki T, Sihto H, Holli K, Turpeenniemi-Hujanen T, Kataja V, Sailas L, Isola J, Lundin J. [Development and evaluation of a virtual microscopy application for automated assessment of Ki-67 expression in breast cancer]. BMC Clin Pathol. 2011; 11 (3): 1-11.
Mezei T, Szakács M, Dénes L, Jung J, Egyed-Zsigmond I. [Semiautomated image analysis of high contrast tissue areas using Hue/Saturation/ Brightness based color filtering]. Acta Medica Marisiensis. 2011; 57 (6): 679-684.
Tony JC. [ImageJ for microscopy]. BioTechniques. 2007; 43 (1): 25-30.
Schindelin J, Rueden CT, Hiner MC, Eliceiri KW. [The ImageJ ecosystem: an open platform for biomedical image analysis]. Mol Reprod Dev. 2015: 1-12.
##submission.downloads##
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2018 Morphologia
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно поширювати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи в цьому журналі.
Автори, направляючи рукопис до редакції журналу «Morphologia», погоджуються з тим, що редакції передаються права на захист і використання рукопису (переданого до редакції матеріалу, в тому числі таких об'єктів, що охороняються авторським правом, як фотографії автора, малюнки, схеми, таблиці і т.п.), в тому числі на відтворення в пресі і в мережі Інтернет; на поширення; на переклад рукопису на будь-які мови; експорту та імпорту примірників журналу зі статтею Авторів з метою поширення, доведення до загального відома. Зазначені вище права Автори передають Редакції без обмеження терміну їх дії і на території всіх країн світу без обмеження.
Автори гарантують, що вони мають виняткові права на використання матеріалів, переданих до редакції. Редактори не несуть відповідальності перед третіми особами за порушення гарантії, надані авторами. Розглянуті права передаються до редакції з моменту підписання поточної публікації для публікації. Відтворення матеріалів, опублікованих в журналі іншими особами та юридичними особами, можливе лише за згодою редакції, з обов'язковим зазначенням повної бібліографічного посилання первинної публікації. Автори залишають за собою право використовувати опублікований матеріал, його фрагменти і частини для навчальних матеріалів, усні презентації, підготовку дисертації дисертації з обов'язковою бібліографічною посиланням на оригінальну роботу. Електронна копія опублікованій статті, що завантажується з офіційного веб-сайту журналу в форматі .pdf, може бути розміщена авторами на офіційному веб-сайті їх установ, будь-яких інших офіційних ресурсах з відкритим доступом.
