Методологія використання програмного забезпечення для аналізу цифрових мікрофотографій на базі курсу патоморфології з метою підвищення професійного рівня студентів і науковців

Автор(и)

  • O. V. Poslavska ДЗ «Дніпропетровська медична академія МОЗ України», Україна

DOI:

https://doi.org/10.26641/1997-9665.2015.3.122-126

Ключові слова:

аналіз цифрових зображень, ImageJ, індекс проліферації

Анотація

Стаття присвячена методології використання програмного забезпечення для аналізу цифрових мікрофотографій в патоморфології на прикладі розрахунку індексу проліферації зразків з імуногістохімічним забарвленням різними плагінами програми "ImageJ". За мету ставиться ознайомлення студентів медичних факультетів, аспірантів та здобувачів-дослідників з сучасними комп’ютерними технологіями для підвищення їх професійного рівня.

Посилання

Tuominen VJ, Ruotoistenmäki S, Viitanen A, Jumppanen M, Isola J. [ImmunoRatio: a publicly available web application for quantitative image analysis of estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and Ki-67]. Breast Cancer Research. 2010; 12 (4, R56): 1-12.

Konsti J, Lundin M, Joensuu H, Lehtimaki T, Sihto H, Holli K, Turpeenniemi-Hujanen T, Kataja V, Sailas L, Isola J, Lundin J. [Development and evaluation of a virtual microscopy application for automated assessment of Ki-67 expression in breast cancer]. BMC Clin Pathol. 2011; 11 (3): 1-11.

Mezei T, Szakács M, Dénes L, Jung J, Egyed-Zsigmond I. [Semiautomated image analysis of high contrast tissue areas using Hue/Saturation/ Brightness based color filtering]. Acta Medica Marisiensis. 2011; 57 (6): 679-684.

Tony JC. [ImageJ for microscopy]. BioTechniques. 2007; 43 (1): 25-30.

Schindelin J, Rueden CT, Hiner MC, Eliceiri KW. [The ImageJ ecosystem: an open platform for biomedical image analysis]. Mol Reprod Dev. 2015: 1-12.

##submission.downloads##

Номер

Розділ

Статті