Лазерний топологічний спекл-аналізатор проліферативної та диференціаційної активності в культуральному морфогенезі.
DOI:
https://doi.org/10.26641/1997-9665.2011.4.10-19Ключові слова:
проліферація, диференціювання, гістоморфогенез, лазерна морфометрія, проективна морфологія, топологічні методиАнотація
Реалізована автоматизована система морфолого-топологічного визначення фаз поділу клітин і структурної диференціації тканин у ході морфогенезу, заснована на топологічних властивостях клітинних культур, що розглядаються в рамках наївної теорії множин. Елементарний роботизований програмно-апаратний комплекс на базі мікроскопа Zeiss з модифікованим предметним столиком і маніпулятора Velleman моделі KSR-1 дозволяє керувати положенням лазерного модуля, здійснюючи кутове опромінення зразків як в трансмісійному, так і в темнопольному або люмінесцентному режимах, і математичну обробку результатів реєстрації. Дана малобюджетна система може бути зібрана і запрограмована в умовах цитоморфологічної або гістоморфологічної лабораторії з використанням підручних засобів. Програмний код для обробки даних у MATLAB наводиться в тексті статті.
Посилання
Absolute instruments and perfect imaging in geometrical optics / T. Tyc, L. Herzanova, M. Sarbort, K. Bering // New J. of Physics. – 2011. – Vol. 13. – 23 p.
An automated microscopy system MECOS-C2 and its trials / V. S. Medovyi, A. A. Parpara, A. M. Pyatnitskii [et al.] // Biomed. Engineer. – 2006. - № 4. – P. 197-202.
Berezkin V. G. Four-dimensional thin-layer chromatography / V. G. Berezkin, S. S. Khrebtova, N. Yu. Kulakova // Dok. Phys. Chem. – 2009 – Vol. 429, № 1. - P. 229-232.
Berry M. V. Topological events on wave dislocation lines: birth and death of loops, and reconnection / M. V. Berry, M. R. Dennis // J. of Phys. A. : Mathematical and Theoretical. – 2007. – Vol. 40. – P. 65-74.
Blot G. Automatisation de l'analyse granulometrique. Presenation d'un nouveau capteur de formes, le videogranulometrie : [Réf. ATILH n24143] / G. Blot // Rev. Gen. des Rout. et Aer. – 1987. – Vol. 61, № 639. – P. 39-43.
Chromatographic fingerprint analysis of herbal medicines / [eds. : H. Wagner, R. Bauer, D. Melchart, P.-G. Xiao, A. Staudinger]. – Springer, 2011. – 1064 p.
Computational algebraic topology approach for optical flow / M.-F. Auclair-Fortier, P. Poulin, D. Ziou [et al.] // Pat. Recog. – [proc. 16th ICPR]. – 2002. – Vol. 1. – P. 352–355.
Dennis M. R. Correlations and screening of topological charges in Gaussian random fields/ M. R. Dennis // J. of Phys. A : Mathematical and General. – 2003. – Vol. 36. – P. 6611-6628.
Dennis M. R. Superoscillation in speckle patterns / M. R. Dennis, A. C. Hamilton, J. Courtial // Optics Letters. – 2008. – Vol. 33. – P. 2976-2978.
Dennis M. R. Topological configurations of optical phase singularities / M. R. Dennis // Topologica. – 2009. – Vol. 2. – P. 007-1-007-10.
Hass H. C. Deposition processes under changing climate: upper subatlantic granulometric records from the Skagerrak (NE-North Sea) / H. C. Hass // Marine Geology. – 1993. – V l. 111. – P. 361-378.
Kramer J. Quantitative evaluation of gel electrophoretic patterns by videodensitometry / J. Kramer, N. B. Gusev, P. Friedrich // Anal. Biochem. – 1980. – Vol. 102, № 2. – P. 295-298.
“MECOS-C: return to image analysis in microscope examination of blood smears” / G. Kozinets, V. Medovy, A. Pyatnitsky [et al.] // Proc. SPIE “Optical Diagnostic of Living Cell 2”. – 1998. – Vol. 3. – P. 260.
O'Holleran K. Topology of light's darkness / K. O'Holleran, M. R. Dennis, M. J. Padgett // Phys. Rev. Letters. – 2009 – Vol. 102. – P. 143902-1-143902-4.
O'Holleran K. Topology of optical vortex lines formed by the interference of three, four, and five plane waves / K. O'Holleran, M. J. Padgett, M. R. Dennis // Optics Express. – 2006. – Vol. 14. – P. 3039-3044.
Polarization singularities in 2D and 3D speckle fields / F. Flossmann, K. O'Holleran, M. R. Dennis, M. J. Padgett // Phys. Revi. Letters. – 2008. – Vol. 100. – P. 203902-1-203902-4.
Primel L. Aggregates: geology, prospection, environment, testing, specifications, extraction, processing plants, equipments, quality control / L. Primel, C. Tourenq. – Taylor & Francis, 2000. – 590 p. - [Eng. trans.]. – (Primel L., Tourenq C. Granulats, Presses de l'Ecole Nationale des Ponts et Chauess, 1990).
Silverman N. R. Clinical video-densitometry, pulmonary ventilation analysis / N. R. Silverman // Radiology. – 1972. – V l. 103. – P. 263-265.
Skeleton-based morphological shape comparison / Y. V. Vizilter, S. V. Sidyakin, A. Y. Rubis, V. Gorbatsevich // Pat. Recog. and Image Anal. – 2011. – Vol. 21, № 2. – P. 357-360.
Soponar F. Quantitative evaluation of paracetamol and caffeine from pharmaceutical preparations using image analysis and RP-TLC / F. Soponar, A. C. Mot, C. Sarbu // Chromatographia. – 2009. – Vol. 69, № 1-2. – P. 151-155.
Vizilter Y. V. Design of data segmentation and data compression operators based on projective morphological decompositions / Y. V. Vizilter // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2009. – Vol. 48, № 3. – P. 415-429.
Vizilter Y. V. Projective morphologies and their application in structural analysis of digital images / Y. V. Vizilter, S. Y. Zheltov // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2008. – Vol. 47, № 6. – P. 944-958.
Vizilter Y. V. The use of projective morphologies for object detection and identification in images / Y. V. Vizilter, S. Y. Zheltov // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2009. – Vol. 48, № 2. – P. 282-294.
##submission.downloads##
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2018 Morphologia
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0), яка дозволяє іншим особам вільно поширювати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи в цьому журналі.
Автори, направляючи рукопис до редакції журналу «Morphologia», погоджуються з тим, що редакції передаються права на захист і використання рукопису (переданого до редакції матеріалу, в тому числі таких об'єктів, що охороняються авторським правом, як фотографії автора, малюнки, схеми, таблиці і т.п.), в тому числі на відтворення в пресі і в мережі Інтернет; на поширення; на переклад рукопису на будь-які мови; експорту та імпорту примірників журналу зі статтею Авторів з метою поширення, доведення до загального відома. Зазначені вище права Автори передають Редакції без обмеження терміну їх дії і на території всіх країн світу без обмеження.
Автори гарантують, що вони мають виняткові права на використання матеріалів, переданих до редакції. Редактори не несуть відповідальності перед третіми особами за порушення гарантії, надані авторами. Розглянуті права передаються до редакції з моменту підписання поточної публікації для публікації. Відтворення матеріалів, опублікованих в журналі іншими особами та юридичними особами, можливе лише за згодою редакції, з обов'язковим зазначенням повної бібліографічного посилання первинної публікації. Автори залишають за собою право використовувати опублікований матеріал, його фрагменти і частини для навчальних матеріалів, усні презентації, підготовку дисертації дисертації з обов'язковою бібліографічною посиланням на оригінальну роботу. Електронна копія опублікованій статті, що завантажується з офіційного веб-сайту журналу в форматі .pdf, може бути розміщена авторами на офіційному веб-сайті їх установ, будь-яких інших офіційних ресурсах з відкритим доступом.