Лазерний топологічний спекл-аналізатор проліферативної та диференціаційної активності в культуральному морфогенезі.

Автор(и)

  • A. V. Notchenko Лабораторія нейронної структури мозку Наукового Центру Неврології РАМН, Москва, РФ МДТУ ім. Н.Е.Баумана, Москва, РФ, Russian Federation
  • O. V. Gradov Лабораторія нейронної структури мозку Наукового Центру Неврології РАМН, Москва, РФ Institute of Mathematical Statistics, Maryland, USA SIAM Activity Group of Life Science, Philadelphia, USA, Russian Federation

DOI:

https://doi.org/10.26641/1997-9665.2011.4.10-19

Ключові слова:

проліферація, диференціювання, гістоморфогенез, лазерна морфометрія, проективна морфологія, топологічні методи

Анотація

Реалізована автоматизована система морфолого-тополо­гіч­но­го визначення фаз поділу клітин і структурної диференціації тканин у ході морфогенезу, заснована на топологічних властивостях клітинних культур, що розглядаються в рамках наївної теорії множин. Елементарний роботизований програмно-апаратний комплекс на базі мікроскопа Zeiss з модифікованим предметним столиком і маніпулятора Velleman моделі KSR-1 дозволяє керувати положенням лазерного модуля, здійснюючи кутове опромінення зразків як в трансмісійному, так і в темнопольному або люмінесцентному режимах, і математичну обробку результатів реєстрації. Дана малобюджетна система може бути зібрана і запрограмована в умовах цитоморфологічної або гістоморфологічної лабораторії з використанням підручних засобів. Програмний код для обробки даних у MATLAB наводиться в тексті статті.

Посилання

Absolute instruments and perfect imaging in geometrical optics / T. Tyc, L. Herzanova, M. Sarbort, K. Bering // New J. of Physics. – 2011. – Vol. 13. – 23 p.

An automated microscopy system MECOS-C2 and its trials / V. S. Medovyi, A. A. Parpara, A. M. Pyatnitskii [et al.] // Biomed. Engineer. – 2006. - № 4. – P. 197-202.

Berezkin V. G. Four-dimensional thin-layer chromatography / V. G. Berezkin, S. S. Khrebtova, N. Yu. Kulakova // Dok. Phys. Chem. – 2009 – Vol. 429, № 1. - P. 229-232.

Berry M. V. Topological events on wave dislocation lines: birth and death of loops, and reconnection / M. V. Berry, M. R. Dennis // J. of Phys. A. : Mathematical and Theoretical. – 2007. – Vol. 40. – P. 65-74.

Blot G. Automatisation de l'analyse granulometrique. Presenation d'un nouveau capteur de formes, le videogranulometrie : [Réf. ATILH n24143] / G. Blot // Rev. Gen. des Rout. et Aer. – 1987. – Vol. 61, № 639. – P. 39-43.

Chromatographic fingerprint analysis of herbal medicines / [eds. : H. Wagner, R. Bauer, D. Melchart, P.-G. Xiao, A. Staudinger]. – Springer, 2011. – 1064 p.

Computational algebraic topology approach for optical flow / M.-F. Auclair-Fortier, P. Poulin, D. Ziou [et al.] // Pat. Recog. – [proc. 16th ICPR]. – 2002. – Vol. 1. – P. 352–355.

Dennis M. R. Correlations and screening of topological charges in Gaussian random fields/ M. R. Dennis // J. of Phys. A : Mathematical and General. – 2003. – Vol. 36. – P. 6611-6628.

Dennis M. R. Superoscillation in speckle patterns / M. R. Dennis, A. C. Hamilton, J. Courtial // Optics Letters. – 2008. – Vol. 33. – P. 2976-2978.

Dennis M. R. Topological configurations of optical phase singularities / M. R. Dennis // Topologica. – 2009. – Vol. 2. – P. 007-1-007-10.

Hass H. C. Deposition processes under changing climate: upper subatlantic granulometric records from the Skagerrak (NE-North Sea) / H. C. Hass // Marine Geology. – 1993. – V l. 111. – P. 361-378.

Kramer J. Quantitative evaluation of gel electrophoretic patterns by videodensitometry / J. Kramer, N. B. Gusev, P. Friedrich // Anal. Biochem. – 1980. – Vol. 102, № 2. – P. 295-298.

“MECOS-C: return to image analysis in microscope examination of blood smears” / G. Kozinets, V. Medovy, A. Pyatnitsky [et al.] // Proc. SPIE “Optical Diagnostic of Living Cell 2”. – 1998. – Vol. 3. – P. 260.

O'Holleran K. Topology of light's darkness / K. O'Holleran, M. R. Dennis, M. J. Padgett // Phys. Rev. Letters. – 2009 – Vol. 102. – P. 143902-1-143902-4.

O'Holleran K. Topology of optical vortex lines formed by the interference of three, four, and five plane waves / K. O'Holleran, M. J. Padgett, M. R. Dennis // Optics Express. – 2006. – Vol. 14. – P. 3039-3044.

Polarization singularities in 2D and 3D speckle fields / F. Flossmann, K. O'Holleran, M. R. Dennis, M. J. Padgett // Phys. Revi. Letters. – 2008. – Vol. 100. – P. 203902-1-203902-4.

Primel L. Aggregates: geology, prospection, environment, testing, specifications, extraction, processing plants, equipments, quality control / L. Primel, C. Tourenq. – Taylor & Francis, 2000. – 590 p. - [Eng. trans.]. – (Primel L., Tourenq C. Granulats, Presses de l'Ecole Nationale des Ponts et Chauess, 1990).

Silverman N. R. Clinical video-densitometry, pulmonary ventilation analysis / N. R. Silverman // Radiology. – 1972. – V l. 103. – P. 263-265.

Skeleton-based morphological shape comparison / Y. V. Vizilter, S. V. Sidyakin, A. Y. Rubis, V. Gorbatsevich // Pat. Recog. and Image Anal. – 2011. – Vol. 21, № 2. – P. 357-360.

Soponar F. Quantitative evaluation of paracetamol and caffeine from pharmaceutical preparations using image analysis and RP-TLC / F. Soponar, A. C. Mot, C. Sarbu // Chromatographia. – 2009. – Vol. 69, № 1-2. – P. 151-155.

Vizilter Y. V. Design of data segmentation and data compression operators based on projective morphological decompositions / Y. V. Vizilter // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2009. – Vol. 48, № 3. – P. 415-429.

Vizilter Y. V. Projective morphologies and their application in structural analysis of digital images / Y. V. Vizilter, S. Y. Zheltov // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2008. – Vol. 47, № 6. – P. 944-958.

Vizilter Y. V. The use of projective morphologies for object detection and identification in images / Y. V. Vizilter, S. Y. Zheltov // J. of Comp. and Sys. Sci. Intern. – 2009. – Vol. 48, № 2. – P. 282-294.

##submission.downloads##

Номер

Розділ

Статті